Un sistema di visualizzazione molecolare veramente open source creato dal team PyMOL
PyMOL (pleomorphic analysis methodology) è un prodotto software sviluppato da Warren Lyle Delano. PyMOL è stato commercializzato per la prima volta da DeLano Scientific LLC, un'azienda privata di software dedicata allo sviluppo di strumenti utili per le comunità scientifiche ed educative di tutto il mondo. Si basa sulle stesse metodologie di analisi piromorfiche utilizzate nel campo della biologia strutturale. Questo tipo di analisi viene utilizzato per caratterizzare diverse sostanze organiche e inorganiche con l'uso di strumenti sensibili.
Ad oggi, questo prodotto è ampiamente utilizzato in biologia strutturale, astronomia e altri campi. Molte istituzioni, tra cui il Jet Propulsion Laboratory (JPL), la NASA e l'Università della California a Berkeley utilizzano PyMOL. L'obiettivo principale dei fondatori di PyMOL era quello di sviluppare prodotti software open-source per l'analisi di vari tipi di molecole e atomi organici. Fin dall'inizio, il programma è stato modificato e adattato per applicazioni in molti campi, tra cui la chimica, l'astronomia, l'informatica e le scienze farmaceutiche. Anche molte altre università e istituti superiori hanno adattato PyMOL per applicazioni di ampio respiro nelle proprie strutture di ricerca. Ci sono due componenti chiave di questo pacchetto open-source che lo distinguono da altri strumenti e soluzioni software open-source disponibili sul mercato.
La prima componente di PyMOL è il fatto che si tratta di un sistema di visualizzazione di molecole open source creato e sviluppato da un rinomato team di scienziati e ingegneri di DeLano Scientific LLC. PyMOL è stato concesso in licenza per supportare le esigenze delle comunità scientifiche ed educative, tra cui l'Office of Scientific and Engineering Research (OSER) del Dipartimento dell'Energia, i National Institutes of Health (NIH) e il Defense Advanced Research Projects (DARPA). Un'altra componente importante del software di visualizzazione molecolare open source è che è compatibile e accessibile attraverso il Common Gateway for Educational Software (CAGE), un archivio online gestito dall'Agenzia statunitense per lo sviluppo dell'istruzione e della ricerca (UREA). Poiché PyMOL è accessibile su più piattaforme, tra cui Windows, Linux, UNIX e Solaris, è molto comodo da implementare e utilizzare per le istituzioni educative.
